Admirál James T. Kirk je Klingonskou říší obviněn z krádeže klingonské vesmírné lodi a označen za teroristu a zločince. Federace proto Kirka a posádku zničené lodi Enterprise povolává zpět na Zemi před soud. Jejich cesta je ale přerušena, když se objeví záhadná, mimořádně silná vesmírná sonda, která okamžitě po příletu na oběžnou dráhu Země začíná sterilizovat zemský povrch. Spock rozřeší záhadu sondy a celá posádka musí na ukořistěné klingonské lodi přejmenované na Bounty cestovat časem do 20. století, aby se pokusili zachránit pozemský život.